1. Objet
Le Spatial Transcriptomics Data Atlas recense des publications de transcriptomique spatiale (Visium, Xenium, MERFISH, CosMx, GeoMx, Stereo-seq, etc.), classées par tissu, plateforme, espèce et condition, avec des liens vers les données déposées par les auteurs. L'accès est libre et gratuit. En utilisant le site, vous acceptez les présentes conditions.
2. Nature des informations
Les études ont été repérées dans le texte intégral d'Europe PMC et dans NCBI GEO, puis chaque article a été lu par un agent fondé sur un modèle de langage, qui a renseigné le tissu, la plateforme, les échantillons et la disponibilité des données, et a consulté la liste des fichiers des dépôts quand c'était possible. Ces informations peuvent contenir des erreurs ou être incomplètes.
« Raw data » signifie que des fichiers spatiaux issus de l'instrument ont été vus dans le dépôt ; « Processed only » signifie que seuls des matrices ou objets traités ont été vus. La mention « unverified » sur un lien signifie que le contenu du dépôt n'a pas pu être consulté. Les fiches en « low confidence » ont été établies à partir du résumé seul.
Vérifiez toujours l'article et le dépôt d'origine avant toute utilisation.
3. Usage autorisé
L'atlas est destiné à la recherche et à l'information. Il ne constitue pas un avis médical, un outil de diagnostic ni une aide à la décision clinique. Il est interdit d'utiliser le site de manière à en perturber le fonctionnement, ou d'extraire massivement son contenu par des moyens automatisés abusifs.
4. Responsabilité
Le site et ses données sont fournis « en l'état », sans garantie d'exactitude, de disponibilité ou d'adéquation à un usage particulier. Dans les limites permises par la loi, l'éditeur n'est pas responsable des dommages résultant de l'utilisation du site ou de la confiance accordée à ses données. Les liens vers des sites tiers (DOI, PubMed, PMC, GEO, Zenodo, etc.) sont fournis pour information ; l'éditeur n'est pas responsable de leur contenu ni des conditions d'accès aux données qu'ils hébergent.
5. Licences et réutilisation
Licence des annotations de l'atlas et des exports (fichier data/atlas.json, export CSV) : Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0). Vous pouvez copier, redistribuer et adapter ces données, y compris commercialement, à condition de citer « Spatial Transcriptomics Data Atlas, KIMA Holding » et d'indiquer les modifications.
Les articles appartiennent à leurs auteurs et éditeurs. Les jeux de données liés restent soumis aux licences et conditions d'accès de leurs dépôts d'origine.
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7. Modification des conditions
L'éditeur peut modifier ces conditions ; la version en ligne fait foi, avec sa date de mise à jour.
8. Droit applicable
Les présentes conditions sont régies par le droit français. En cas de litige, et à défaut d'accord amiable, les tribunaux français sont compétents, sous réserve des règles impératives applicables aux consommateurs.